所謂的Arduino軟體開發環境，裡頭包含了很多部分：
- USB轉換序列埠的驅動程式
- 範例程式碼（閃爍LED、讀取數位腳位、PWM、等等）
- Arduino的核心（定義HIGH與LOW常數值、函式pinMode()、等等）
- 內建程式庫（讀寫EEPROM、控制LCD、控制伺服馬達、步進馬達、等等）
- 開發工具鏈（編譯器、連結器、燒錄程式等等）
- bootloader（要放進板子裡的快閃記憶體）
- 文件資料
- 整合式開發環境（以Java語言撰寫）
- 等等其他東西
P.S. 我的Arduino軟體開發環境是1.0版、Windows版。
首先以File-Preferences開啟偏好設定值的視窗。
說明如下：
Sketchbook location:
指向sketchbook目錄，底下存放你寫的程式碼。若你有從別的地方抓取額外的程式庫，請在這個目錄底下新增一個子目錄，並命名為libraries，然後把程式庫放在這個libraries子目錄底下。
設定好後，就可以File-Sketchbook開啟程式碼。若有安裝程式庫，以Tools-Import Library...匯入程式庫的標頭檔，若程式庫裡有範例程式，則會出現在File-Examples底下。
sketchbook目錄預設路徑為：
Windows是C:\Documents and Settings\My Documents\Arduino，
Mac是使用者家目錄下的Documents/Arduino/（/Users//Documents/Arduino/），
Linux是家目錄下的sketchbook目錄。
Editor font size:
字型大小，要重新啟動才生效。
Show verbose output during:
compilation，編譯程式時，輸出較詳細的訊息。upload，上傳程式時（從電腦到板子），輸出較詳細的訊息。
Delete previous applet or application folder on export
這似乎是Arduino開發環境的前身，Processing，的設定值。Processing可以將程式輸出成為內嵌在HTML檔裡的Java Applet，這個設定值會控制要不要刪除先前的內容。在Arduino上這個設定值似乎沒用（我不確定）。
Use external editor
你嫌Arduino開發環境的編輯器不好用嗎，打開這個選項，使用你愛用的編輯器吧，編輯存檔後，按下Arduino開發環境裡的Verify/Compile鈕或Upload鈕，就會載入更新後的檔案。
Check for updates on startup
啟動時檢查有無新版本。我通常會關掉。
Update sketch files to new extension on save (.pde -> .ino)
Arduino 1.0版將程式碼的附檔名從先前的.pde改成.ino，打開這個選項會幫你自動重新改名。你可以取消勾選，新版還是看得懂以前的.pde檔。
Automatically associate .ino files with Arduino
將附檔名.ino跟Arduino關聯在一起，也就是說，預設以Arduino開發環境開啟.ino檔。
More preferences can be edited directly in the file
C:\Documents and Settings\\Application Data\Arduino\preferences.txt
(edit only when Arduino is not running)
之前所設定的值，都會存在這個preferences.txt檔裡，裡面還有更多其他的設定值。preferences.txt的預設路徑如下：
- Windows XP，C:\Documents and Settings\
Application Data\Arduino\preferences.txt。 - Windows Vista，C:\Users\
\AppData\Roaming\Arduino\preferences.txt。 - Mac，/Users/
/Library/Arduino/preferences.txt。 - Linux，~/.arduino/preferences.txt。
更多設定值：
不過光看它不知道怎麼設定，請參考Arduino目錄下的arduino-1.0\lib\preferences.txt（不要直接修改此檔），裡頭有設定值的敘述說明，而且，可以找出更多可用的設定值，部分說明如下：
注意，修改preferences.txt時，要先把Arduino關掉，不然設定值會被覆寫。
sketchbook.path=
路徑，這就是設定先前的Sketchbook location，可以用相對路徑（相對於Arduino開發環境的執行檔arduino.exe）、或用絕對路徑。
settings.path=
路徑，preferences.txt這支設定檔的路徑，可以用相對路徑（相對於Arduino開發環境的執行檔arduino.exe）、或用絕對路徑。
build.path=
路徑，編譯時的暫存目錄，若不設定就會使用系統的暫存目錄。platform.auto_file_type_associations=
true或false，這就是之前的Automatically associate .ino files with Arduino。
build.verbose=
upload.verbose= true或false，這就是之前Show verbose output during:。
update.check =
true或false，這就是之前的Check for updates on startup。
platform.auto_file_type_associations =
true或false，這就是之前的Automatically associate .ino files with Arduino。
editor.window.width.default =
editor.window.height.default =
editor.window.width.min =
editor.window.height.min =
數字，設定視窗預設與最小的高度寬度，請自己試試看。
editor.font=
例如Monospaced,plain,12，設定字型與大小。editor.antialias=
true或false，true的話會打開反鋸齒效果，文字會比較好看。
editor.external=
true或false，這就是之前的Use external editor。
last.sketch.count=
0或1或其他數字，啟動後會開啟上次離開時的程式。但是，若是以視窗右上角的X叉叉關閉的話，這個值會變成0。所以，要以File-Quit離開Arduino軟體開發環境。上次開啟的程式檔會記錄在下列設定值裡。
last.sketch0.path=
last.sketch1.path=
...路徑。
console= true
true或false，要不要把編譯、上傳過程的訊息輸出到主控台。
console.output.file=
預設為stdout.txt，標準輸出的儲存檔案。裡面會是編譯時的訊息。
console.error.file=
預設為stderr.txt，標準錯誤的儲存檔案。裡面會是上傳時的訊息。
console.auto_clear=
true或false，要不要清除主控台先前的內容。
console.length=
預設為500，主控台能記住的行數。
board =
例如uno，你的板子，也就是Tools-Board，可用設定值在hardware\arduino\boards.txt。
serial.port=
例如COM1，序列埠號，也就是Tools-Serial Port。serial.databits=8
serial.stopbits=1
serial.parity=N
serial.debug_rate=9600
序列傳輸的設定。
programmer=arduino:avrispmkii
額外的programmer燒錄器（上傳），可用設定值在hardware\arduino\programmers.txt。
upload.using=bootloader
上傳的方式，預設值為bootloader，代表利用Arduino板子微控制器裡的bootloader進行上傳（韌體燒錄）。可用設定值在hardware\arduino\programmers.txt，以另外的programmer燒錄器進行上傳，譬如AVR ISP，
裡頭還有其他的設定值，可以自行改改看，但請記得先做備份。
參考資料：
- Arduino官方網站文件，Arduino Preferences，Burning sketches to the Arduino board with an external programmer，Bootloader Development。
- Cooper Maa的Arduino IDE Tweak (開發環境調校)。
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